SDIT Umar Bin Khathab Kudus berdiri sejak 12 Juli 2011 dibawah naungan Yayasan Sosial Pendidikan (YSP) Al-Fath Kudus. Sejak awal berdirinya, SDIT Umar Bin Khathab Kudus konsisten memadukan kurikulum pendidikan nasional dari Kementerian Pendidikan, kurikulum Sekolah Islam Terpadu (SIT) dan kurikulum kecapakan dasar yang meliputi kecakapan literasi dan numerasi; ketrampilan digital (skill IT); kecakapan hidup (life skill); dan kecakapan dalam berinteraksi dengan lingkungan (social skill). Keterpaduan kurikulum itu pula menjadi salah satu faktor yang mendorong orangtua siswa memilihkan SDIT Umar Bin Khathab Kudus sebagai tempat pendidikan putra-putrinya. Secara akademik siswa tidak tertinggal dalam pembelajaran umum, namun di sisi yang lain siswa mendapat pendidikan keagamaan, pembiasaan ibadah, mengaplikasikan akhlaq dan perilaku yang baik, cinta tanah air dan bangsa. Untuk mencapai visi terbentuknya generasi yang Alim, Mandiri dan Peduli Lingkungan, SDIT Umar Bin Khathab Kudus membuka tiga kelas unggulan yaitu kelas program Bahasa, kelas program Sains-IT dan kelas program Tahfidz.
