Ekstrakurikuler di SDIT Umar Bin Khathab Kudus merupakan sarana positif berbentuk kegiatan tambahan yang dilakukan di luar jam pelajaran yang dilakukan baik di sekolah maupun luar sekolah dengan tujuan untuk mendapatkan tambahan pengetahuan, keterampilan dan wawasan serta membantu membentuk karakter peserta didik SDIT Umar Bin Khathab Kudus sesuai dengan minat dan bakat masing-masing.
Adapun pilihan ekskul yang tersedia di SDIT Umar Bin Khathab Kudus meliputi:
